Рубрика: Разное
Massenspektrometrie
Massenspektrometrie
Als Massenspektrum (oft fälschlich ebenfalls abgekürzt als MS), das eine zweidimensionale Information von Ionenhäufigkeit vs. Ionenmasse zu Ladungs Verhältnis (m/z) darstellt, werden die bei der Ionisierung einer Substanz erzeugten Ionen entweder gleichzeitig oder zeitlich nacheinander registriert. Die Intensität wird aus der Fläche oder einfach der Höhe der Signale, der sogenannten Peaks, ermittelt und üblicherweise auf den intensivsten Peak im Spektrum, den sogenannten Basispeak (base peak) normiert (rel. Int. %). Massenspektren werden entweder als Strichspektren dargestellt oder, wenn die Peakform ein Rolle spielt, als Profilspektren. Die Alternative bzw. Ergänzung dazu ist ein Peaklisting, das die exakte Information zu Masse und Intensität liefert. Als Totalionenstrom (totalion current, TIC) bezeichnet man die Summe der Ströme, die von den Ionen aller m/z-Werte im Spektrum erzeugt wird. Außer auf den Basispeak, kann man Spektren auch auf %TIC oder auf %TICx, d. h. %TIC oberhalb m/z x, normieren.
Grundlagen der Massenspektroskopie
Grundlagen der Massenspektroskopie
Die Ionen [M+] werden durch eine ange-legte Spannung V beschleunigt und treten in ein Magnetfeld H ein, dessen Feldlinien senkrecht zur Zeichenebende stehen. Als bewegte Ladung stellen die Ionen einen Strom dar, der vom Magnetfeld in eine Kreisbahn gezwungen wird.
Mass Spectrometry based Proteomics and Metabolomics
Mass Spectrometry based Proteomics and Metabolomics
Problem Statement
• Database/Data Exchange
– Record keeping:
• experimental manipulations
• measurement conditions
– Data exchange format
• Data Analysis
– Baseline removal, denoising, peak identification, associate peaks with disease
– Computational load
– Reproducible data analysis
Genomes to Life: Technology Assessment for Mass Spectrometry
Genomes to Life: Technology Assessment for Mass Spectrometry
Over the past decade, mass spectrometry (MS) has become the most widely used analytical tool for characterizing proteins and other biomolecules. MS undoubtedly will play an important role in the Department of Energy’s Genomes to Life (GTL) program developed by the Office of Science offices of Biological and Environmental Research (BER) and Advanced Scientific Computing Research (ASCR). The GTL program has four goals, all focused on understanding the composition and function of the biochemical networks and pathways that carry out the essential processes of living organisms. Although MS will be utilized in Goals 1, 2, and 3, it is particularly relevant to Goal 1, which is to identify life’s molecular machines, the multiprotein complexes that carry out the function of living systems. In addition, MS will require and, in turn, drive the development of the computational tools described in Goal 4.